Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp2Q06649 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp2Q06649 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp2Q06649 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms