Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cab39Q06138 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms