Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdk18Q04899 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdk18Q04899 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk18Q04899 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms