Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox10Q04888 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox10Q04888 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox10Q04888 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms