Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RelbQ04863 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RelbQ04863 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RelbQ04863 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms