Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Top1Q04750 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Top1Q04750 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms