Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smarcad1Q04692 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smarcad1Q04692 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms