Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crisp1Q03401 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Crisp1Q03401 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Crisp1Q03401 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Crisp1Q03401 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms