Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx2Q03358 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx2Q03358 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms