Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddr1Q03146 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms