Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fgfr4Q03142 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms