Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna1sQ02789 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1sQ02789 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms