Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gjb5Q02739 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb5Q02739 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms