Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gja5Q01231 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms