Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col1a2Q01149 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms