Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pde1bQ01065 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms