Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csf2raQ00941 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Csf2raQ00941 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf2raQ00941 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csf2raQ00941 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms