Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VegfaQ00731 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms