Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms