Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmmrQ00547 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HmmrQ00547 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HmmrQ00547 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms