Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Flt3Q00342 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Flt3Q00342 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms