Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms