Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb4P99026 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms