Protein–RNA interactions for Protein: P97766

Cfc1, Cryptic protein, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfc1P97766 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfc1P97766 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfc1P97766 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms