Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pitx2P97474 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitx2P97474 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms