Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps3aP97351 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3aP97351 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms