Protein–RNA interactions for Protein: P86049

Rbm46, Probable RNA-binding protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm46P86049 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm46P86049 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm46P86049 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms