Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NyxP83503 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NyxP83503 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NyxP83503 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NyxP83503 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NyxP83503 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NyxP83503 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NyxP83503 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NyxP83503 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NyxP83503 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NyxP83503 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NyxP83503 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NyxP83503 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NyxP83503 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NyxP83503 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NyxP83503 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NyxP83503 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NyxP83503 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NyxP83503 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NyxP83503 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms