Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9xP70398 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp9xP70398 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp9xP70398 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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