Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stra8P70278 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stra8P70278 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stra8P70278 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Stra8P70278 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stra8P70278 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Stra8P70278 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stra8P70278 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stra8P70278 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stra8P70278 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stra8P70278 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stra8P70278 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms