Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg2P63268 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actg2P63268 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actg2P63268 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms