Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfybP63139 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfybP63139 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfybP63139 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfybP63139 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfybP63139 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfybP63139 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfybP63139 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfybP63139 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfybP63139 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms