Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabra1P62812 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms