Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf3P61205 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf3P61205 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arf3P61205 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arf3P61205 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms