Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap25P60879 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap25P60879 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap25P60879 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms