Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrn4P59383 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrn4P59383 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms