Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CgnP59242 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CgnP59242 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CgnP59242 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CgnP59242 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CgnP59242 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CgnP59242 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CgnP59242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CgnP59242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CgnP59242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CgnP59242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CgnP59242 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CgnP59242 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CgnP59242 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CgnP59242 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms