Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctdsp1P58466 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdsp1P58466 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms