Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bace1P56818 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bace1P56818 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace1P56818 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms