Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp5P56399 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp5P56399 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms