Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcd3P55096 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd3P55096 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms