Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a1P55014 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a1P55014 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc12a1P55014 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc12a1P55014 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms