Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PctpP53808 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PctpP53808 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PctpP53808 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PctpP53808 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PctpP53808 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PctpP53808 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PctpP53808 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PctpP53808 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PctpP53808 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PctpP53808 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PctpP53808 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms