Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fdft1P53798 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fdft1P53798 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms