Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efnb1P52795 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms