Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc1a1P51906 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc1a1P51906 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms