Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn1swP51491 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn1swP51491 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms