Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FmodP50608 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FmodP50608 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FmodP50608 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FmodP50608 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FmodP50608 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FmodP50608 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FmodP50608 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FmodP50608 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FmodP50608 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms