Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LtbrP50284 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LtbrP50284 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LtbrP50284 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LtbrP50284 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms