Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtshP49935 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtshP49935 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtshP49935 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtshP49935 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtshP49935 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtshP49935 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtshP49935 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtshP49935 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtshP49935 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtshP49935 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtshP49935 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtshP49935 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtshP49935 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtshP49935 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtshP49935 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtshP49935 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtshP49935 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtshP49935 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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